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新疆不同來源金黃殼囊孢菌依據表型特征被劃分為15個類群，具有不同表型特征的菌株對碳源的利用數量和利用能力也存在差異。金黃殼囊孢不同類群的劃分與寄主和地理來源無顯著相關性, 與表型特征和生理生化特征具有相關性，研究結果為新疆不同類型金黃殼囊孢的準確判斷提供了依據。

新疆地處亞歐大陸腹地，是我國西北邊陲重地。獨特的地理環境和氣候條件孕育了豐富的殼囊孢屬真菌，其中金黃殼囊孢分布最為廣泛。以金黃殼囊孢為主的腐爛病的發生影響了新疆林木的健康生長、生態環境的保護和經濟社會的發展。前期研究發現，新疆不同來源金黃殼囊孢的培養性狀存在差異，而不同培養性狀金黃殼囊孢的碳源代謝特征、培養性狀分化現象與該菌的來源及在生長過程中的代謝水平是否具有相關性，尚未開展過相關研究。針對這一科學問題, 本研究在全疆范圍內收集殼囊孢屬真菌，通過形態學和分子生物學方法從6個地區5種不同寄主上收集到47株金黃殼囊孢菌，通過形態學特征結合生理生化標記及ISSR分子標記技術共同探討新疆不同來源金黃殼囊孢的種內遺傳差異，為該菌分類地位的確定及田間癥狀的準確診斷提供理論依據。

通過觀察不同來源金黃殼囊孢菌株的菌落顏色、形態、產生子實體的特征等數據，將不同特征的非數值型培養性狀轉化為數值型，使用NTSYSpc2.10軟件進行UPGMA聚類分析后得出,當遺傳相似系數為0.52時，47株菌株被劃分為具有不同培養性狀的15大類群。其中菌落顏色及孢子分布相同的菌株聚為一個類群，表明金黃殼囊孢表型類型豐富，各菌株親緣關系的遠近與菌株的培養性狀密切相關。本研究首次通過Biolog-FF技術揭示了不同金黃殼囊孢菌對碳源利用的種類和數量存在差異。當遺傳分化系數為0.3349時，47株金黃殼囊孢在親緣關系上被劃分為兩大類群，其中對碳源利用數量最少，代謝活性最低的菌株形成了一個類群；具有單獨利用碳源的6株金黃殼囊孢菌聚為一個類群，表明金黃殼囊孢的遺傳多樣性、培養性狀及生理生化特性之間存在明顯相關性。本研究明確了新疆金黃殼囊孢的危害特征、培養特征和碳源代謝種類和數量間的相關性，為今后的由金黃殼囊孢引起的病害的診斷和防治提供理論依據。