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藻類（algae）是一類復雜的生物類群，目前為止仍沒有清晰和明確的定義，涵蓋了從單細胞到多細胞、從原核生物到真核生物的多種生命形式，是地球上最古老的光合生物類群之一。在海洋環境中，海藻（seaweed）特指大型、多細胞的定生藻類，主要包括大型的紅藻（Rhodophyta）、褐藻（Phaeophyceae）和綠藻（Chlorophyta）等類群。藻類在海洋生態系統中占據重要地位，不僅是初級生產力的關鍵貢獻者，同時也為眾多海洋生物提供棲息地和食物來源。

藻類作為地球上最古老且多樣性極為豐富的生物類群之一，在進化起源上既相互關聯，又在漫長的歷史中各自獨立演化，其演化歷程完整記錄了生命從簡單到復雜的進化軌跡，映射了整個生物界從原始生命向高等生命體進化的宏大歷程。在這一演化過程中，藍細菌（Cyanobacteria）作為最早出現的原核藻類，通過產氧光合作用徹底改變了地球大氣組成，成為生態系統自由氧的最初貢獻者，并為后續需氧真核生物的演化提供了關鍵環境條件。

Fig. 1 Cyanobacterium Synechocystis sp. PCC 6803

根據內共生假說，大約在N億年之前，發生了初級內共生事件，一個真核生物吞噬了藍細菌，出現了具有原始質體（藍小體）的灰色藻門（Glaucophyta），其特征性的結構保留了內共生起源的原始特征，被認為是最早出現的真核藻類類群，此后，進一步演化形成綠藻和紅藻兩大類群，構成了現代真核生物多樣性的基礎。這一進化過程不僅體現了內共生事件在生命演化中的核心作用，也展現了藻類在連接原核與真核生命世界中的獨特地位。

Fig. 2 Schematic view of plastid evolution in the history of eukaryotes.

此后，藻類的演化歷程中發生了多次關鍵的次級內共生事件。單細胞真核綠藻和紅藻先后作為內共生體，被其他真核宿主細胞吞噬。在這一過程中，原始的內共生體逐漸被整合：其外膜系統經過復雜改造，形成了多層膜包被的質體結構，并伴隨著膜轉運系統的逐步完善。

綠藻發生了重要的演化：一支成功登陸并最終演化成為陸地植物；另一支通過次級內共生形成了絲足蟲門的綠蛛藻（Chlorarachniophytes）和眼蟲門的裸藻（Euglenophytes）。

紅藻的演化路徑更為復雜，通過多次獨立的次級內共生事件，它們被不同的真核宿主細胞攝取，最終演化形成隱藻（Cryptophytes）、定鞭藻（Haptophytes）、不等鞭毛類（Stramenopiles）、甲藻（Dinoflagellates）以及頂復門（Apicomplexa）等重大類群。

Fig. 3Plastid evolution

隨著對生物認知的不斷深化，關于藻類起源、系統演化及物種形成的理論假說將持續得到驗證、修正和完善，推動藻類進化生物學研究不斷向前發展。